Formado en 1998 por Benjamin Burnley (vocalista), Jeremy Hummel (baterista) y Jonathan "Bug" Price (ex-bajista), Breaking Benjamin rápidamente obtuvo un fuerte seguimiento local en su estado natal, Pennsylvania. La banda debe su nombre a un incidente cuando Burnley, quien solía hacer covers de Nirvana como solista en clubes nocturnos, tiró casualmente el micrófono al suelo, rompiéndolo. La persona que era propietaria del micrófono en el escenario llegó y dijo: "Denle gracias a Benjamin por romper mi maldito micro". En un principio (1999) se hacían llamar Plan 9, sin embargo, en el 2001, la banda cambió su nombre a Breaking Benjamin y dos amigos de Burnley, Aaron Fink y Mark Klepaski (este último sustituye a Jonathan Price) dejaron su anterior banda, Lifer, y se unieron a las filas de Breaking Benjamin como guitarrista y bajista respectivamente. Según la banda, el logotipo de Breaking Benjamin, una variación del nudo celta, se encontró en un libro de tatuajes, por un fan. El logotipo también es tatuado en la muñeca izquierda de Ben Burnley, Aaron Fink y Mark James Klepaski, y la muñeca derecha de Chad Szeliga.

La banda firmó un contrato con Hollywood Records en 2001, editando un EP homónimo que vendió 2.000 copias. Tras esto decidieron lanzar al mercado su primer álbum, Saturate el 27 de agosto del 2002. El álbum alcanzó el puesto 2 en el Top "Billboard Heatseekers Chart" y el 136 en el Top Billboard 200. El primer single del álbum fue la canción Polyamorous, que fue recibido en la radio con expectación, a partir de él se hicieron dos videos: la versión original, y la versión con escenas del videojuego Run Like Hell que es incluido en el disco de la banda.

 El segundo single fue titulado  Skin el cual alcanzó un éxito similar a "Polyamorous". Fue interpretado en vivo en varios programas de TV incluyendo "Last Call: With Carson Daly," "The Late Late Show With Craig Kilborn" y Jimmy Kimmel Live."

El siguiente single fue Medicate.

La canción "Wish I May" aparece en el filme de terror